Para definir sus prioridades y validar la estrategia y el plan de acción, la Eurorregión cuenta con dos instancias con representación paritaria de las tres regiones que la integran: una asamblea compuesta por 18 miembros y un comité ejecutivo integrado por 6.
La presidencia es bianual y es ejercida por cada una de las regiones de manera alternativa. Navarra ostenta la presidencia de 2024 a 2026.
Asamblea
Navarra

María Chivite Navascués
Presidenta de la Comunidad foral de Navarra

Oscar Chivite Cornago
Consejero de Cohesión Territorial

Mikel Irujo Amezaga
Consejero de Desarrollo Económico y Empresarial

Ana Ollo Hualde
Consejera de Relaciones Ciudadanas

Juan Luis García Martín
Consejero de Universidad, Innovación y Transformación Digital

Sergio Pérez García
Director General de Acción exterior
Euskadi

Imanol Pradales Gil
Lehendakari

Ibone Bengoetxea Otaolea
Vicelehendakari primera y Consejera de Cultura y Política Lingüística

Juan Ignacio Pérez Iglesias
Consejero de Ciencia, Universidades e Innovación

Javier Hurtado Domínguez
Consejero de Turismo, Comercio y Consumo

Ander Caballero Barturen
Secretario General de Acción Exterior y Euskadi Global

Mikel Antón Zarragoitia
Director de Asuntos Europeos
Nouvelle-Aquitaine

Alain Rousset
Presidente del Conseil Régional de Nouvelle-Aquitaine

Mathieu Bergé
Consejero regional delegado a la Eurorregión, la Cooperación Transfronteriza, Puertos y Aeropuertos

Andde Sainte Marie
Consejero regional responsable de Montaña y Pastoralismo

Emilie Dutoya
Consejera regional

François Verrière
Consejero regional

Maïder Arosteguy
Consejera regional
Comité ejecutivo
Navarra

Sergio Pérez García
Director General de Acción Exterior

Iñigo Arruti Torre
Director General de Fomento Comercial
Euskadi

Ander Caballero Barturen
Secretario General de Acción Exterior y Euskadi Global

Mikel Antón Zarragoitia
Director de Asuntos Europeos
Nouvelle-Aquitaine

Mathieu Bergé
Consejero regional delegado a la Eurorregión, la Cooperación Transfronteriza, Puertos y Aeropuertos

Andde Sainte Marie
Consejero regional responsable de Montaña y Pastoralismo